产品货号:
YTB4633
中文名称:
磁珠法动物mRNA提取试剂盒
英文名称:
BalbMag Animal mRNA Isolation Kit with Magnetic Beads
产品规格:
50T|200T|800T
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本制品是一种使用Oligo(dT)25包被的磁珠,配合优化的缓冲体系,用于稳定、高效、便捷地从动物组织或培养的动物细胞中快速分离纯化获得高纯度完整mRNA的试剂盒。本制品提取的poly(A) RNA中也可以包含带有poly(A)的lncRNA等,但通常主要为mRNA,因此被称为mRNA提取试剂盒。
本试剂盒中的BalbMag Oligo(dT)25磁珠粒径约为200nm,浓度约为5mg/mL。每mg磁珠偶联的Oligo (dT)25约为300-400pmol,每mg磁珠可纯化约2~3μg mRNA,每mL磁珠可以纯化约10~15μg mRNA。
本试剂盒提取的mRNA可直接应用于RT-PCR、qPCR、高通量测序、mRNA文库的构建、固相cDNA文库构建、Northern blot分析、RACE等分子生物学实验,还可用于mRNA疫苗的研发等。
一个典型的哺乳动物细胞中,四种主要的大分子的质量和占比为:RNA,~20pg (1%);DNA,~7pg (0.3%);protein,~500pg (20%);polysaccharide (多糖),~2μg (78.7%)。信使RNA (mRNA)约占总RNA质量的4%,核糖体RNA (ribosomal RNA,简称rRNA)约占80%。
组分 | 50T | 200T | 800T |
BalbMag Oligo(dT)25磁珠 | 1mL | 4mL | 16mL |
溶液I (结合液) | 30mL | 120mL | 480mL |
溶液Ⅱ (裂解液) | 30mL | 120mL | 480mL |
溶液Ⅲ (洗涤液I) | 30mL | 120mL | 480mL |
溶液Ⅳ (洗涤液Ⅱ) | 60mL | 240mL | 480mL×2 |
溶液Ⅴ (洗脱液) | 5mL | 20mL | 80mL |
保存:2~8℃,有效期1年。
- BalbMag Oligo(dT)25磁珠长期不使用时,可以-20℃保存,-20℃可以保存更长时间。整个试剂盒-20℃可以保存更长时间。
- 操作过程要严格保证无RNA酶和DNA酶污染。对于操作环境中RNase的去除,推荐使用核酸酶喷雾清除剂以去除实验桌面上或其它接触面上的RNase。
- 本制品的所用试剂和耗材都要求是RNase-free和DNase-free的,操作时应小心,避免被污染。如果耗材可能有RNase污染,可考虑用0.01%的DEPC水浸泡过夜,然后高温高压灭菌并烘干。如果可能有DNase污染,通常高温高压灭菌可以使DNase灭活。
- 温度较低时,溶液II (裂解液)可能会有沉淀产生。使用前必须检查一遍。如有沉淀,可置于室温或者37℃水浴溶解,混匀后使用。
- 分装或使用磁珠时,请适当涡旋震荡或反复颠倒以确保磁珠充分混匀。
- 磁分离前应适度震荡离心管使磁珠充分分散后再靠近磁场。如果出现磁珠挂壁现象,可以在磁珠聚集后晃动管内液体,使挂壁的磁珠流下。
- 请使用推荐的细胞量或组织量,否则可能造成磁珠聚集,会影响洗涤进而影响提取获得的mRNA纯度。发生磁珠聚集时,洗涤时需尽量分散磁珠,这样可有效改善提取效果。如果发生磁珠聚集现象,建议在后续实验中适当减少总细胞量和总组织量。
- 由于mRNA容易降解,提取获得的mRNA推荐尽快用于RT-PCR等后续实验。如果不能尽快使用,需要-80℃保存。
本试剂盒的原理和主要操作流程如图1所示。BalbMag Oligo (dT)25磁珠表面共价修饰了25聚dT序列即Oligo (dT)25,当真核细胞、动植物组织的裂解液与BalbMag Oligo (dT)25磁珠混合后,磁珠表面的寡聚dT序列与mRNA 3'端的poly(A)进行碱基配对而特异性结合,然后在外界磁场的作用下,磁珠与相应溶液可以快速而高效地分离,经洗涤充分去除杂质,最后用洗脱液将mRNA从磁珠上洗脱下来,即可获得高纯度完整mRNA。
图1.BalbMag磁珠法动物mRNA提取试剂盒的工作原理示意图。
本试剂盒具有提取效果稳定、纯度高、速度快、操作便捷等优点。本试剂盒的mRNA提取体系经过反复测试和优化,能从106个细胞中提取约0.1~1μg mRNA,20mg小鼠肝组织能提取约0.2~2μg mRNA,20mg小鼠肺组织能提取约0.1~1μg mRNA。仅需孵育、洗涤、洗脱等简单的操作,整个纯化过程不超过15分钟即可完成。所有操作都在同一个离心管中完成,操作便捷。本试剂盒的检测效果及与离心柱式动物RNA提取试剂盒、国外同类竞品的检测效果比较参见图2。
图2.本试剂盒用于从HEK293T细胞和小鼠组织中提取mRNA的效果图。图A为使用柱式动物RNA提取试剂盒(货号:YTB4004)及本试剂盒分别提取HEK293T细胞的总RNA和mRNA,然后使用一步法荧光定量RT-PCR试剂盒(SYBR Green)和Actin、B2M和GAPDH的三对内参引物进行qRT-PCR检测,图中可见使用本试剂盒提取的mRNA与离心柱式动物RNA提取试剂盒提取的总RNA,qPCR检测的Ct值基本一致。图B为本试剂盒及国外同类产品Competitor C提取小鼠组织(肝脏、肺和肌肉)的mRNA,然后使用一步法荧光定量RT-PCR试剂盒(SYBR Green)和GAPDH内参引物进行qRT-PCR检测,图中可见使用本试剂盒及国外同类竞品提取的mRNA,qPCR检测的Ct值基本一致。实际结果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
- 准备工作。
- 溶液I (结合液)、溶液II (裂解液)、溶液Ⅲ (洗涤液I)和溶液Ⅳ (洗涤液Ⅱ)使用前平衡至室温。溶液Ⅴ(洗脱液)在使用前置于冰上或者2~8℃保存。如果溶液有沉淀,适当水浴或者振荡溶解。
- 细胞样品的准备。
- 贴壁细胞用PBS洗涤一次;悬浮细胞1000~2000×g室温离心5分钟,弃上清,用PBS洗涤一次。
- 按照细胞量加入推荐的溶液II (裂解液)。通过移液器吹打多次,裂解细胞至溶液变粘稠。
- 选做:加入溶液Ⅱ (裂解液)后样品可能会比较粘稠,可适当超声或使用1mL注射器反复抽吸打断基因组DNA从而使粘稠感消失。此操作会产生泡沫,但不影响mRNA的得率。
- 4℃以14000×g离心5分钟,并将上清转移至一个新的离心管。上清可用于mRNA纯化,或保存在-80℃备用。
- 贴壁细胞用PBS洗涤一次;悬浮细胞1000~2000×g室温离心5分钟,弃上清,用PBS洗涤一次。
- 动物组织样品的准备。
- 取所需量的动物组织,置于液氮中研磨成粉末,立即加入推荐量的溶液Ⅱ (裂解液)。也可将组织置于1.5mL离心管中,迅速加入推荐量的冰浴预冷的溶液Ⅱ (裂解液),用微型电动匀浆器匀浆,或者用普通玻璃匀浆器进行匀浆。
- 4℃以14000×g离心5分钟,并将上清转移至一个新的离心管。上清可用于mRNA纯化,或保存在-80℃备用。
- 取所需量的动物组织,置于液氮中研磨成粉末,立即加入推荐量的溶液Ⅱ (裂解液)。也可将组织置于1.5mL离心管中,迅速加入推荐量的冰浴预冷的溶液Ⅱ (裂解液),用微型电动匀浆器匀浆,或者用普通玻璃匀浆器进行匀浆。
- BalbMag Oligo (dT)25磁珠的准备。
- 将磁珠溶液从4℃冰箱取出,适当涡旋震荡或反复颠倒以确保磁珠充分混匀。参考下表,根据总细胞量或组织重量和样品数量,取适量的BalbMag Oligo (dT)25磁珠悬液至一洁净离心管中。
Cell number Tissue mass Lysis Buffer Beads Wash Solution I Wash Solution Ⅱ <5×105 <5mg 100μL 20μL 500μL 500μL each time 1~2×106 5~20mg 300μL 40μL 500μL 500μL each time 3~5×106 20~50mg 600μL 100μL 500μL 500μL each time - 无论磁珠用量多少,按照每个样品200μL溶液I (结合液)的量,加入适量溶液I (结合液)洗涤磁珠,用移液器轻轻吹打重悬磁珠。置于磁力架上分离30秒,去除上清。重复本步骤1次。
- 如果样品数量超过5个,可以考虑将适量磁珠悬液先直接置于磁力架上分离30秒,去除上清,然后根据样品数量再加入适量溶液I (结合液)洗涤2次。
- 按照每个样品100μL溶液I (结合液)的量,加入适量溶液I (结合液)重悬磁珠。
- 将磁珠溶液从4℃冰箱取出,适当涡旋震荡或反复颠倒以确保磁珠充分混匀。参考下表,根据总细胞量或组织重量和样品数量,取适量的BalbMag Oligo (dT)25磁珠悬液至一洁净离心管中。
- 溶液I (结合液)、溶液II (裂解液)、溶液Ⅲ (洗涤液I)和溶液Ⅳ (洗涤液Ⅱ)使用前平衡至室温。溶液Ⅴ(洗脱液)在使用前置于冰上或者2~8℃保存。如果溶液有沉淀,适当水浴或者振荡溶解。
- 从细胞或组织样品中提取mRNA。
- 取上述制备好的细胞或组织样品与100μL洗涤后的磁珠在室温下旋转混合5分钟。
- 置于磁力架上分离1分钟,去除上清。
- 室温下用500μL溶液Ⅲ (洗涤液I)洗涤磁珠,磁分离30秒,去上清。
- 室温下用500μL溶液Ⅳ (洗涤液Ⅱ)洗涤磁珠,磁分离30秒,去上清。重复本步骤1次。
- 根据后续实验需求,进行mRNA的洗脱:
- 取上述制备好的细胞或组织样品与100μL洗涤后的磁珠在室温下旋转混合5分钟。
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